Về cơ chế bảo mật của FTP còn khá hạn chế và bộc lộ nhiều khuyết điểm yếu kém dễ bị những hacker chuyên nghiệp tấn công. Nhưng xét về mặt tổng thể và ứng dụng thì giao thức này vẫn hết sức tuyệt vời trong việc gửi nhận file dữ liệu từ hệ thống máy chủ.